Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam222bQ6P539 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms