Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms