Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms