Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms