Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1Q6NXH3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms