Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms