Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms