Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms