Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms