Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms