Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pram1Q6BCL1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms