Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
N4bp1Q6A037 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms