Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms