Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms