Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpgs2Q66JT5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpgs2Q66JT5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms