Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms