Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Surf4Q64310 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms