Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms