Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2kQ63871 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms