Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms