Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpd52Q62393 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms