Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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