Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms