Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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