Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3cQ62181 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms