Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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