Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha7Q61772 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms