Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms