Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna11Q61716 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna11Q61716 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna11Q61716 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna11Q61716 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifna11Q61716 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms