Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms