Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vsx2Q61412 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vsx2Q61412 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vsx2Q61412 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vsx2Q61412 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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