Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde3bQ61409 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms