Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cacna1eQ61290 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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