Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcd2Q61285 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Abcd2Q61285 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Abcd2Q61285 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcd2Q61285 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms