Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd6Q61003 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms