Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms