Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp3Q60770 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms