Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcf4Q60722 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms