Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim38Q5SZ99 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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