Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms