Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms