Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Trim58Q5NCC9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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