Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms