Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufaf2Q59J78 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms