Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms