Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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