Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms