Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp48Q3V0C5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms