Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms