Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm12888Q3UW77 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm12888Q3UW77 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm12888Q3UW77 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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